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搜索代谢生物标记物
通过 lcms-it-tof 搜索生物标记物
通过结合使用高精度质谱仪(msn ) 与多元统计分析和公式预测工具对代谢生物标记物进行搜索
生物样品中像代谢产物,包括在血液和组织中的内源性代谢物和药物等低分子量化合物,都是非常重要的候选化合物。
lcms-it-tof 高效液相色谱质谱仪可提供多种代谢物的高度精确质量信息。该系统结合了通过优化的lc系统的分离与高性能的混合(四极离子阱(qit)/飞行时间 (tof))质谱仪。
以下为通过使用lcms-it-tof对患有ii型糖尿病的老鼠模型(zucker鼠)血浆中生物标记物的分析。
预处理后的样品由lcms-it-tof进行分析,使用多元分析软件对主成分的分析用来确定正常型与患有ii型糖尿病老鼠的差异。
之后,对结果中的两组定量差异进行分析,其重点在于脂质成份的分析。根据m/z值绘制出多张色谱图。精确的质量信息以及 msn 通过数据库检索使用公式预测软件和化合物的鉴定用于公式的预测。
公式预测软件产生一个单一的公式,数据库检索鉴定为1-palmitoyllysophatidylcholine (棕榈溶血卵磷脂)。其他脂质以同种方式鉴定。
所以,lcms-it-tof可以获得高质量精确值的msn信息。岛津公司这款关于msn的独特公式预测软件可以精确识别组成分子式。
lcms-it-tof为一款液相色谱质谱仪,将高性能液相色谱仪与离子阱(it)质谱仪和飞行时间(tof)的质谱仪相结合。它将离子阱质谱仪的msn性能与高分辨率、高精度的飞行时间质谱仪的质量测量相结合,从而达到传统lc/ms/ms从未听说过的高精准质量测量。
这是一个强大的用于寻找低分子量生物标记物的工具。
代谢组学分析软件
profileram 代谢组学分析软件对从质谱仪获取的大量数据进行统计分析。它将两组或多组样品进行比较和统计叠加,以识别对样品组差别影响最大的代谢产物。
profiler am 软件允许通过比较样品从而进行主成分分析以及聚类分析,非常适合从大量数据中搜索出具有特点变化的成分(生物标记物)。
高通气量以及全面的代谢物检测和识别请见metidsolution代谢产物的结构分析软件。
公式预测软件
此软件根据准确质量数提供多种分子式预测。它可以通过代谢物同位素模式匹配以及msn信息减少可能的代谢物的数量。
它提供了高度可靠的代谢物成分鉴定。