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蛋白质分析软件 (选件)

lcms-it-tof自动化功能的优势，可以得到最充分的开发利用。使用蛋白的方法创建一个峰值列表，并设置数据库的搜索参数，允许所有操作从分析到蛋白质鉴定的自动化。鉴定结果可以直接通过蛋白质分析软件浏览，数据管理既简便又确定。方法重建也可以进行参数修改。

nanoesi 接口 (选件)

nano electrospray nes-100

获取更高灵敏度的高精度lcms-it-tof数据！纳升喷雾提供高电离效率并减少损失。使用nanoesi（纳米电喷雾）接口允许超低样品量进行较高灵敏度的分析。拆装也很容易，与标准的esi接口相比，并不需要更多的工作。

分析示例: 胰蛋白酶酶切的bsa (50 fmol)

当用高效液相色谱法分离一种蛋白质酶切产物时，可以观察几十到数百个峰值。因此，多个肽在几秒钟之内洗脱并不罕见。在这种情况下，高速且智能自动的msⁿ分析提供了更高的覆盖率。此外，ms高精度质谱图有助于进一步改善蛋白质分析的可靠性。蛋白质分析软件窗口如下图所示。可以同时观看到每个数据文件的ms数据以及mascot的搜索结果。

mascot的搜索结果显示出bsa获得1180的最高得分。此外，所有搜索结果在4ppm的质量误差范围内的肽都被对应（外标法）。这即是当使用高精度lcms-it–tof可能获得一个高质量的分析实例。